Grâce à l’action des chercheurs, la biodiversité aquatique et humide d’Île-de-France est de mieux en mieux connue. Deux semaines après la Journée mondiale des zones humides, établie chaque 2 février, un webinaire a permis de faire le point sur ces mares, avec un focus sur la ville de Paris. Une exploration d’un bestiaire dont l’état de santé reste encourageant.
Avec l’Association nationale des élus des bassins (ANEB), la Société nationale de protection de la nature (SNPN) est co-animatrice du Pôle-relais mares et vallées alluviales. Ce Pôle-relais se charge de l’animation d’un réseau d’acteurs concerné par la gestion et la restauration des zones humides et cherche à diffuser les connaissances autour de ces milieux. C’est dans ce cadre que s’est tenu le webinaire “La biodiversité aquatique et humide en zone urbaine dense : zoom sur la ville de Paris”, organisé par l’Agence régionale de la biodiversité (ARB) d’Ile-de-France et la SNPN le mardi 17 février 2026. Différents chercheurs se sont relayés pour offrir un aperçu de la situation des zones humides de Paris, écosystèmes riches en biodiversité, milieux de mieux en mieux pris en compte et protégés.
Historique des mares de Paris
Les mares correspondent aux étendues d’eau de faible dimension dont le renouvellement est limité. Elles constituent des puits de carbone autant qu’un concentré de biodiversité remarquable : néanmoins, 90 % d’entre elles ont disparu au cours du siècle dernier et 50 % entre 1950 et 1990, comme l’a rappelé Bertrand Sajaloli, maître de conférences à l’université d’Orléans. Associées au monde rural et à une forme de décomposition, les mares ont été reconnues tardivement pour leur intérêt écologique.
À Paris, les zones humides avaient disparu (jusqu’en 1932 et la création d’une mare au jardin sauvage du Jardin des Plantes) et ont été reconstituées avec succès : on comptait 182 bassins végétalisés dans la capitale en 2023, en plus de mares saisonnières fluctuantes dont l’inventaire est plus ardu. Les mares sont des objets hybrides : fortement anthropisées, elles constituent un outil de l’aménagement des espaces verts à dimension esthétique, sorte d’échantillon de campagne au cœur de la ville, mais sont tout autant des écosystèmes miniatures, fragilisés par les plantes envahissantes ou les lâchers de poissons rouges. Ainsi, le maintien de mares en bonne santé et en milieu urbain demande un travail d’ingénierie permanent et des moyens alloués.

Connaître et protéger les zones humides
La préservation des mares est portée par cinq Pôles-relais zones humides répartis sur le territoire français. Afin de coordonner les actions de connaissance et de sécuriser les financements nécessaires à leur préservation, un plan d’action Mares a été lancé en 2025 suite à une commande du ministère de la Transition écologique et de la Cohésion des territoires à la SNPN. Localement, des subventions sont désormais accordées par la région dans le cadre de l’appel à projets 1000 mares en Île-de-France, avec jusqu’à 5 000 € d’aide pour la création de mares et 2 500 € pour leur restauration.
Un observatoire participatif des mares est aussi mis à disposition de tous depuis 2010. Porté par l’ARB d’Île-de-France, le portail Géonature permet à chacun de réactualiser les données associées aux mares près de chez lui (prise de photo, description de la faune et de la flore, signalement de la présence de déchets…) et ainsi contribuer à connaître et préserver ces zones humides.

À Paris, la bonne santé des milieux aquatiques
La trame verte et bleue et ses connexions écologiques permettent une grande diversité d’espèces animales et végétales sur l’ensemble du territoire parisien : 91 habitats et sous-habitats sont référencés à Paris et permettent d’accueillir des espèces variées. Dans le cas des espaces humides, les espèces dites cibles, les plus sensibles à un milieu dégradé, sont bien présentes dans la capitale. Après la bouvière dont la présence dans les lacs du bois de Vincennes a surpris les chercheurs, le brochet dispose depuis peu de deux frayères dans les cours d’eau de Paris intra muros : près de la Cité des sciences dans la darse du fond de Rouvray, et dans le bassin de l’Arsenal à la jonction entre la Seine et le canal Saint-Martin. Selon Xavier Japiot, chargé d’études en biodiversité à la ville de Paris, c’est une preuve concrète de la bonne santé du fleuve.
Se dessine un grand trombinoscope animalier, indigène comme exotique. Sur les douze espèces d’écrevisses dont trois espèces locales présentes en Île-de-France, seules deux espèces introduites sont observées dans les mares des bois de Boulogne et de Vincennes : l’écrevisse rouge américaine et l’écrevisse de Louisiane. Les amphibiens, bien présents et protégés par la loi française depuis 2007, font l’objet de programmes spécifiques qui leur permet de s’extraire des mares à l’aide d’un système de rampe. Alors qu’elle n’en comprenait que trois en 1970, la Seine comporte jusqu’à 43 espèces de poisson différentes aujourd’hui, sans oublier des coquillages semi-aquatiques comme l’ambrette commune, ou la corbicule asiatique et la dreissène russe, toutes deux envahissantes. Dans le fleuve de l’une des villes les plus denses au monde, il y a même des éponges d’eau douce !
Les moules d’eau douce, révélatrices de la qualité d’un milieu aquatique
Connaissez-vous les moules d’eau douce ? D’une taille de quelques centimètres, ce sont d’abord des organismes filtreurs : en pompant l’eau pour se nourrir, elles retiennent les particules en suspension, les bactéries, les algues microscopiques et certains polluants. Un seul individu peut filtrer jusqu’à quarante litres d’eau par jour. En plus de clarifier l’eau par ce filtrage, elles stabilisent les sédiments dans le lit de la rivière et participent à limiter l’érosion, maintenant un habitat favorable pour d’autres espèces aquatiques. Par ailleurs, les moules d’eau douce sont considérées comme des bio-indicateurs : très sensibles à la pollution chimique et aux modifications de leur environnement, leur présence ou leur disparition renseigne directement sur l’état de santé d’un cours d’eau.
Durant des siècles, les coquilles des moules d’eau douce ont été collectées pour ornementer vêtements et bijoux. Aujourd’hui menacées par les coquillages envahissants de grande taille capables de filtrer les glochidies (moules au stade larvaire) et ainsi de les tuer, menacées aussi par les barrages et l’irrigation qui perturbent les flux de sédiments, menacées enfin par la pollution ou le changement climatique, le nombre de moules d’eau douce au fond des rivières a grandement diminué. Étudier certaines espèces rares revient ainsi à chercher une aiguille dans une botte de foin.
Mais pour Vincent Prié, biologiste associé au MNHN et directeur de projets au laboratoire SPYGEN, tout a changé grâce à l’utilisation d’un dispositif innovant : pour étudier les moules d’eau douce, désormais, on préserve un ADN parcellaire et dégradé directement dans l’environnement aquatique (ADNe ou ADN environnemental) afin d’identifier les espèces desquelles il provient. 95 % des espèces présentes peuvent être détectées par cette méthode. Elle a permis de constater la présence de 23 espèces différentes de moules d’eau douce dans Paris, dont certaines espèces protégées que l’on croyait jusqu’ici disparues de la capitale, pour le plus grand bonheur des chercheurs. L’étude des moules le prouve : dans le centre de Paris, la Seine a une qualité biologique comparable aux rivières du nord-est de la France. Un constat qui convaincra peut-être de nombreux indécis d’y tester la baignade…■
Découvrez le replay du webinaire et les différentes présentations sur le site de l’ARB d’Île-de-France. Si l’actualité du sujet vous intéresse, inscrivez-vous au Bulletin Groupe Zones Humides, une lettre d’information à parution mensuelle, ou encore à la revue Zones Humides Infos sur le site de la SNPN.
Nathan Arsac
OpenEdition vous propose de citer ce billet de la manière suivante :
Revue Diagonal (9 mars 2026). Une biodiversité riche, entre brochets et moules d’eau douce : cap sur les zones humides de Paris. Revue Diagonal. Consulté le 10 avril 2026 à l’adresse https://doi.org/10.58079/15uag
